Прорыв в диагностике: moPepGen находит скрытые мутации белков
Ученые из Калифорнийского университета и Университета Торонто разработали инновационный вычислительный инструмент для обнаружения ранее недоступных взгляду мутаций в белках. Названный moPepGen, он обещает революционизировать изучение онкологии, нейродегенераций и других патологий, возникающих из-за изменений ДНК.
В основе moPepGen лежит протеогеномика, объединяющая геномный и протеомный анализ. Этот алгоритм впервые дает возможность точно идентифицировать, какие генетические изменения реально проявляются на уровне белковых структур. Это критически важно, так как именно белки управляют функциями организма, а их малейшие дефекты зачастую предвещают развитие тяжелых болезней.
Уникальный алгоритм moPepGen: мощь и точность от Чэнхао Чжу
«Мы создали moPepGen, чтобы безошибочно определять, какие варианты ДНК реально влияют на белки, — пояснил Чэнхао Чжу, участник проекта. — Алгоритм охватывает все типы мутаций и с легкостью обрабатывает колоссальные массивы информации, недоступные прежним методам».
В отличие от предыдущих подходов, фокусировавшихся лишь на простых заменах аминокислот, moPepGen применяет принципиально новую стратегию. Он детально моделирует процессы экспрессии генов и трансляции РНК в белки, учитывая все потенциальные отклонения. Это позволяет получить исчерпывающую и достоверную картину молекулярных событий внутри клетки.
Убедительные результаты: в 4 раза больше находок
Проверка технологии на данных опухолей простаты и почек продемонстрировала ее выдающуюся эффективность. MoPepGen выявил вчетверо больше уникальных белковых вариантов, чем предшествующие методы. Он успешно обнаружил изменения, связанные с комплексными мутациями и масштабными перестройками генов, которые ранее оставались незамеченными.
Путь к персонализированной медицине: надежда от Пола Бутроса
Одно из самых радостных направлений применения moPepGen — это перспектива создания истинно индивидуальных протоколов лечения рака. Инструмент способен точно определять уникальные пептидные маркеры, свойственные опухоли конкретного больного, что абсолютно необходимо для развития персонализированных вакцин и эффективной клеточной терапии.
«Алгоритм открывает возможность связать ДНК-данные с фактическим белковым ландшафтом клеток, — подчеркивает Пол Бутрос, ведущий исследователь. — Это фундаментально меняет принципы медицинского подхода, приближая нас к эпохе подлинной точной медицины». Ранее учеными был достигнут прорыв в повышении действенности редактирования генов.
Источник: www.gazeta.ru
